Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubp1Q811S7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubp1Q811S7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubp1Q811S7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubp1Q811S7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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