Protein–RNA interactions for Protein: Q80X82

Sympk, Symplekin, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SympkQ80X82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SympkQ80X82 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SympkQ80X82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SympkQ80X82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SympkQ80X82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SympkQ80X82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SympkQ80X82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms