Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Npm2Q80W85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Npm2Q80W85 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Npm2Q80W85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Npm2Q80W85 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Npm2Q80W85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms