Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WhrnQ80VW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WhrnQ80VW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WhrnQ80VW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhrnQ80VW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
WhrnQ80VW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhrnQ80VW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms