Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rusc2Q80U22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rusc2Q80U22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rusc2Q80U22 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rusc2Q80U22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rusc2Q80U22 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rusc2Q80U22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rusc2Q80U22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rusc2Q80U22 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rusc2Q80U22 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rusc2Q80U22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rusc2Q80U22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms