Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lca5Q80ST9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lca5Q80ST9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lca5Q80ST9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lca5Q80ST9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms