Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcph1Q7TT79 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcph1Q7TT79 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcph1Q7TT79 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mcph1Q7TT79 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mcph1Q7TT79 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms