Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lamp3Q7TST5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lamp3Q7TST5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lamp3Q7TST5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms