Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccp110Q7TSH4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccp110Q7TSH4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccp110Q7TSH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccp110Q7TSH4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms