Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,36■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
ScocQ78YZ6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,3■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
ScocQ78YZ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,2 ms