Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl2Q78Y63 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdcl2Q78Y63 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcl2Q78Y63 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcl2Q78Y63 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms