Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim12Q78RX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim12Q78RX3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim12Q78RX3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms