Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1cQ76I25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms