Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
March6Q6ZQ89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
March6Q6ZQ89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
March6Q6ZQ89 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
March6Q6ZQ89 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
March6Q6ZQ89 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms