Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LcorQ6ZPI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LcorQ6ZPI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LcorQ6ZPI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LcorQ6ZPI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LcorQ6ZPI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LcorQ6ZPI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LcorQ6ZPI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms