Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd200r4Q6XJV4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r4Q6XJV4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r4Q6XJV4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms