Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Opn5Q6VZZ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Opn5Q6VZZ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Opn5Q6VZZ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms