Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp8b3Q6UQ17 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp8b3Q6UQ17 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp8b3Q6UQ17 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp8b3Q6UQ17 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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