Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt9Q6RHW0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt9Q6RHW0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt9Q6RHW0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt9Q6RHW0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Krt9Q6RHW0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms