Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bnip1Q6QD59 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnip1Q6QD59 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bnip1Q6QD59 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip1Q6QD59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip1Q6QD59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms