Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna2d2Q6PHS9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms