Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx13Q6PHS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx13Q6PHS6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx13Q6PHS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms