Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc57Q6PHN1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc57Q6PHN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc57Q6PHN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms