Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pik3c3Q6PF93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pik3c3Q6PF93 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3c3Q6PF93 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms