Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Herc4Q6PAV2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Herc4Q6PAV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Herc4Q6PAV2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms