Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Gapvd1Q6PAR5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gapvd1Q6PAR5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gapvd1Q6PAR5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Gapvd1Q6PAR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms