Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prkab2Q6PAM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prkab2Q6PAM0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prkab2Q6PAM0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prkab2Q6PAM0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prkab2Q6PAM0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkab2Q6PAM0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms