Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atl2Q6PA06 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl2Q6PA06 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl2Q6PA06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl2Q6PA06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl2Q6PA06 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms