Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx31Q6P8Y7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx31Q6P8Y7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx31Q6P8Y7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx31Q6P8Y7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms