Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snx19Q6P4T1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx19Q6P4T1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms