Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpbp1l1Q6NZP2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms