Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Szrd1Q6NXN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Szrd1Q6NXN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms