Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cep170Q6A065 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cep170Q6A065 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cep170Q6A065 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cep170Q6A065 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cep170Q6A065 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cep170Q6A065 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms