Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msl2Q69ZF8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msl2Q69ZF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msl2Q69ZF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Msl2Q69ZF8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms