Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab3ipQ68EF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab3ipQ68EF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab3ipQ68EF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms