Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a3Q64518 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a3Q64518 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2a3Q64518 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms