Protein–RNA interactions for Protein: Q64356

Svs6, Seminal vesicle secretory protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs6Q64356 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs6Q64356 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Svs6Q64356 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Svs6Q64356 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Svs6Q64356 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms