Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc1Q64028 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc1Q64028 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms