Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift52Q62559 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ift52Q62559 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift52Q62559 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift52Q62559 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ift52Q62559 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ift52Q62559 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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