Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20854Q62461 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20854Q62461 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20854Q62461 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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