Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nptx1Q62443 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nptx1Q62443 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx1Q62443 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx1Q62443 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms