Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelplgQ62170 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelplgQ62170 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelplgQ62170 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms