Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3bQ62141 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sin3bQ62141 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sin3bQ62141 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sin3bQ62141 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms