Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msi1Q61474 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Msi1Q61474 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msi1Q61474 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msi1Q61474 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msi1Q61474 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms