Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcd1Q61466 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcd1Q61466 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcd1Q61466 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcd1Q61466 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms