Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd53Q61451 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd53Q61451 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd53Q61451 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd53Q61451 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd53Q61451 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd53Q61451 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd53Q61451 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms