Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HadhQ61425 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HadhQ61425 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HadhQ61425 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HadhQ61425 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HadhQ61425 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HadhQ61425 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HadhQ61425 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HadhQ61425 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HadhQ61425 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HadhQ61425 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms