Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift88Q61371 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift88Q61371 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift88Q61371 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift88Q61371 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms