Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcf12Q61286 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcf12Q61286 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcf12Q61286 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcf12Q61286 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms