Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lcp1Q61233 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcp1Q61233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcp1Q61233 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.4 ms